Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nop58Q6DFW4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nop58Q6DFW4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms