Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk13Q69ZA1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk13Q69ZA1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk13Q69ZA1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk13Q69ZA1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk13Q69ZA1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms