Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms