Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp9cQ66X01 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp9cQ66X01 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms