Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CilpQ66K08 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms