Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clcn1Q64347 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn1Q64347 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms