Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbr1Q64336 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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