Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa17Q64016 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms