Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms