Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms