Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms