Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VcanQ62059 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VcanQ62059 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VcanQ62059 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcanQ62059 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms