Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sox17Q61473 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sox17Q61473 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sox17Q61473 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sox17Q61473 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox17Q61473 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms