Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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PcolceQ61398 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PcolceQ61398 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PcolceQ61398 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PcolceQ61398 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PcolceQ61398 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcolceQ61398 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PcolceQ61398 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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