Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc125Q5U465 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc125Q5U465 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms