Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPV6

Uncharacterized protein C2orf73 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5SPV6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q5SPV6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5SPV6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5SPV6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms