Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85aQ5SP85 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc85aQ5SP85 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc85aQ5SP85 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85aQ5SP85 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85aQ5SP85 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85aQ5SP85 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms