Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav8d-2Q5R1B6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms