Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim41Q5NCC3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim41Q5NCC3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim41Q5NCC3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms