Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl5Q5DTT4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl5Q5DTT4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms