Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2f8Q58FA4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f8Q58FA4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms