Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WhammQ571B6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms