Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccnl1Q52KE7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccnl1Q52KE7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms