Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2al1nQ497L1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2al1nQ497L1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms