Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc43Q3V0L5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Lrrc43Q3V0L5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Lrrc43Q3V0L5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc43Q3V0L5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc43Q3V0L5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Lrrc43Q3V0L5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc43Q3V0L5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Lrrc43Q3V0L5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc43Q3V0L5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc43Q3V0L5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc43Q3V0L5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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