Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc27Q3V036 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms