Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc114Q3UX62 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms