Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm27235Q3UW50 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm27235Q3UW50 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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