Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd27Q3UMR0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ankrd27Q3UMR0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ankrd27Q3UMR0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ankrd27Q3UMR0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ankrd27Q3UMR0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd27Q3UMR0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms