Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zyg11bQ3UFS0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zyg11bQ3UFS0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms