Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms