Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hace1Q3U0D9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms