Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn4clQ3TYX2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn4clQ3TYX2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms