Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt2Q3TTY5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt2Q3TTY5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms