Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21440Q3TTD8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms