Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fndc4Q3TR08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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