Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpgp1Q3TLS3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpgp1Q3TLS3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpgp1Q3TLS3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpgp1Q3TLS3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpgp1Q3TLS3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpgp1Q3TLS3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpgp1Q3TLS3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms