Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prr27Q3SYJ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms