Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdgfl1Q2VPR5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms