Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Perm1Q149B8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Perm1Q149B8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Perm1Q149B8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Perm1Q149B8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Perm1Q149B8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Perm1Q149B8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Perm1Q149B8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Perm1Q149B8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Perm1Q149B8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Perm1Q149B8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms