Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps8Q0P5W1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps8Q0P5W1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms