Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn2Q08093 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms