Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah2Q06986 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah2Q06986 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms