Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms