Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cab39Q06138 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms