Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc2Q05020 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc2Q05020 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms