Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Emx1Q04742 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Emx1Q04742 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms