Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms