Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms