Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfiaQ02780 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfiaQ02780 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms